Paxgene血液RNA管是一種專(zhuān)門(mén)用于從全血中提取高純度RNA的有效工具。這種系統可以捕獲和穩定血液中的RNA,使得研究人員可以從多種生物樣本中獲得可靠的RNA分析結果。本篇文章將以一個(gè)具體的案例來(lái)說(shuō)明Paxgene血液RNA管的實(shí)際應用效果。
人類(lèi)血液是分子信息的豐富來(lái)源,可用于開(kāi)發(fā)特定腫瘤和器官(例如胎盤(pán))的非侵入性液體活檢,以預測疾病、其進(jìn)展和對治療的反應。近年來(lái),隨著(zhù)微陣列和RNA測序(RNA-Seq)等技術(shù)的普及,全基因組轉錄組分析被應用于發(fā)現分子標記,這些技術(shù)允許同時(shí)測量數以萬(wàn)計的蛋白質(zhì)編碼和非蛋白質(zhì)。開(kāi)發(fā)血液轉錄組標記物以監測整個(gè)懷孕期間的胎盤(pán)功能和產(chǎn)科并發(fā)癥的風(fēng)險需要準確量化基因表達。
來(lái)自美國韋恩大學(xué)醫學(xué)院和密歇根州立大學(xué)的研究團隊發(fā)表了題為“Targeted expression profiling by RNA-Seq improves detection of cellular dynamics during pregnancy and identifies a role for T cells in term parturition"的文章,比較了在外顯子水平探測轉錄組的Affymetrix人類(lèi)轉錄組陣列(HTA 2.0)、具有珠蛋白還原的配對末端Illumina RNA-Seq以及一種新型全基因組靶向表達分析技術(shù) DriverMap,評估了這些方法在母體全血中定量源自胎盤(pán)單細胞基因組的細胞類(lèi)型特異性特征表達的能力,并確定了這些特征是否能表明足月分娩。
由于器官和/或細胞類(lèi)型特異性轉錄本在全血中低表達,因此RNA的完整性、穩定性和RNA的豐度定量對下游實(shí)驗至關(guān)重要。本研究中使用的血液RNA采血管是PAXgene全血RNA管(BD,762165),該管中含有穩定添加劑,可長(cháng)時(shí)間維持細胞 RNA 完整性。
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